A população da espécie na bacia do Rio Tocantins é a que se encontra em estado mais crítico. Além de muito reduzida, está dividida em pequenos grupos incomunicáveis, isolados pelas seis barragens que esquartejaram esse grande rio. O biólogo e conservacionista, Dr. Reuber Brandão, membro do Conselho Consultivo do Instituto Araguaia, comunica que existe um grupo de botos vermelhos ("cor-de-rosa") isolados pelas hidroelétricas de Serra da Mesa e Canabrava, em Goiás. Essa deve ser a população mais meridonal da espécie.